章清

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农学博士，必威betway88欢迎你百人计划A岗，硕士生导师。主要从事植物表观和三维基因组学研究。先后主持和完成国家自然科学基金青年项目、博士后基金面上项目等。近年来，以第一或共同第一作者在Nature plants、Molecular Plant和Nature Communications等国内外著名学术期刊上发表研究论文。

1.学习和工作经历

2025.01-至今      必威betway88欢迎你，betway88必威东盟体育，受聘为必威betway88欢迎你百人计划A岗；

2021.07-2024.12   华中农业大学，植物科学技术学院，博士后；

2015.09-2021.06   华中农业大学，植物科学技术学院，硕博连读；

2011.09-2015.06   华中农业大学，植物科学技术学院，本科；

2.主要研究方向

（1）开发和利用植物表观多组学实验方法，在不同环境和组织中鉴定油菜基因组染色质状态和空间结构。

（2）解析植物种子休眠和萌发过程中的表观和三维基因组的重塑机理。

（3）解析油菜响应寒冷、干旱和病害的表观遗传修饰的分子调控机制，挖掘调控相关农艺性状形成的关键基因和功能性顺式调控元件，并解析其分子调控网络，为油菜种质资创新与遗传改良奠定理论基础和技术支持。

3.主持和参与的研究项目

（1）国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 32200471, 甘蓝型油菜泛表观和三维基因组结构解析, 2023-01-01 至 2025-12-31, 30万元, 主持;

（2）中国博士后科学基金会, 面上项目, 2022M721281, 植物经济器官nChIP-seq技术的建立与甘蓝型油菜种子发育相关的表观遗传调控机制解析, 2023-06 至 今, 8万元, 主持;

（3）国家自然科学基金委员会, 联合基金项目, U22A20469, 油菜耐盐碱生物学基础与种质创新, 2023-01-01 至 2026-12-31, 256万元, 在研, 参与;

（4）国家自然科学基金委员会, 重点项目, 31930032, 油菜hau CMS系统育性转换机理研究, 2020-01-01至 2024-12-31, 302万元, 在研, 参与;

（5）国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 31701163, 植物eChIP-seq技术的建立与甘蓝型油菜表观基因组图谱的构建, 2018-01-01 至 2020-12-31, 25万元, 结题, 参与。

4.专利

（1）赵伦（导师），章清，钟文莹，一种针对植物重要经济器官的 ChIP-seq 染色质免疫共沉淀方法（ZL202311372980.3）

5.讲授课程

植物生理学、生物信息学和功能基因组学

6.代表性研究论文

1.Zhang Q#, Zhong W#, Zhu G. et al. aChIP is an efficient and sensitive ChIP-seq technique for economically important plant organs. Nature Plants. 2024. IF: 15.8

2. Zhang Q#, Guan P#, Zhao L#, Fu T, Li G, Li X, Shen J. Asymmetric epigenome maps of subgenomes reveal imbalanced transcription and distinct evolutionary trends in Brassica napus. Molecular Plant. 2020 Dec 30. IF: 17.1

3. Zhao L#, Xie L#, Zhang Q#, Li G, Li X. Integrative analysis of reference epigenomes in 20 rice varieties. Nature Communications. 2020 May 27. IF: 14.7

4. Zhao L & Zhang Q. aChIP for comprehensive chromatin profiling in economically important plant organs. Nature Plants.10, 1289–1290. 2024. Research Briefing.

5. Zhao L, Deng L, Zhang Q, Jing X, Fu T, Shen J. Autophagy contributes to sulfonylurea herbicide tolerance via GCN2-independent regulation of amino acid homeostasis, Autophagy, 2018, 14(4): 702-714. IF: 14.6

6. Zhao L, Wang S, Cao Z, Ouyang W, Zhang Q, Chromatin loops associated with active genes and heterochromatin shape rice genome architecture for transcriptional regulation, Nature Communications, 2019, 10(1): 3640. IF: 16.6

7. Deng L, Zhou Q, Zhou J, Zhang Q, Li G, Zhao L et al. 3D organization of regulatory elements for transcriptional regulation in Arabidopsis. Genome Biology, 2023, 24, 181. IF: 14.6

8. Xiao Q, Huang X, Zhang Y, Wei Xu, Yang YQ, Zhang Q, Zhe Hu, Li GL & Li XW Li et al. The landscape of promoter-centred RNA–DNA interactions in rice. Nature. Plants, 2022, 8, 157–170. IF:15.8

9. Peng Y, Xiong D, Zhao L, Ouyang WZ, Wang SQ Sun Jun，Zhang Q，Guan P et al. Chromatin interaction maps reveal genetic regulation for quantitative traits in maize. Nature Communications,2019, 10, 2632. IF: 14.7